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の特性 Alliin

の特性 Alliin (C6H11NO3S):

化合物名Alliin
化学式C6H11NO3S
モル質量177.22144 g/モル

化学構造
C6H11NO3S (Alliin) - 化学構造
ルイス構造
3D分子構造
物理的特性
外観白色からオフホワイトの結晶性粉末
溶解度可溶性

の元素組成 C6H11NO3S
元素記号原子量原子重量パーセント
炭素C12.0107640.6634
水素H1.00794116.2562
窒素N14.006717.9035
酸素O15.9994327.0837
硫黄S32.065118.0932
質量パーセント組成原子パーセント組成
C: 40.66%H: 6.26%N: 7.90%O: 27.08%S: 18.09%
C 炭素 (40.66%)
H 水素 (6.26%)
N 窒素 (7.90%)
O 酸素 (27.08%)
S 硫黄 (18.09%)
C: 27.27%H: 50.00%N: 4.55%O: 13.64%S: 4.55%
C 炭素 (27.27%)
H 水素 (50.00%)
N 窒素 (4.55%)
O 酸素 (13.64%)
S 硫黄 (4.55%)
質量パーセント組成
C: 40.66%H: 6.26%N: 7.90%O: 27.08%S: 18.09%
C 炭素 (40.66%)
H 水素 (6.26%)
N 窒素 (7.90%)
O 酸素 (27.08%)
S 硫黄 (18.09%)
原子パーセント組成
C: 27.27%H: 50.00%N: 4.55%O: 13.64%S: 4.55%
C 炭素 (27.27%)
H 水素 (50.00%)
N 窒素 (4.55%)
O 酸素 (13.64%)
S 硫黄 (4.55%)
識別子
CAS番号556-27-4
笑顔C=CCS(=O)CC(C(=O)O)N
笑顔N[C@H](C(=O)O)C[S@@](=O)CC=C
ヒルの公式C6H11NO3S

関連化合物
化合物名
C5H7NOSペナム
C3H3NOSイソチアゾリノン
C2HNO2Sオキサチアゾロン類
C6H5NSON-スルフィニルアニリン
C9H9NOSアスミック
C4H5NOSメチルイソチアゾリノン
C7H5NOSベンゾイソチアゾリノン
C5H5NOSピリチオン
C3H7NO2Sシステイン
C7H5NO3Sサッカリン

関連項目
分子量計算機
酸化状態計算機

アリイン (C₆H₁₁NO₃S): 化学化合物

科学レビュー記事 | 化学リファレンスシリーズ

要約

アリイン (C₆H₁₁NO₃S)、系統名 (2''R'')-2-アミノ-3-[(S)-(プロプ-2-エン-1-スルフィニル)]プロパン酸は、天然に存在するアミノ酸システインのスルホキシド誘導体である。 このキラルな有機硫黄化合物は、163-165°Cの融点範囲を示し、白色から淡黄色の結晶性粉末として現れる。 アリインは、炭素および硫黄中心立体化学の両方を有する最初に発見された天然物として、化学的に重要な意義を持つ。 この化合物は、アリイナーゼによる酵素的変換を介してアリシンの生化学的前駆体として機能し、この反応はネギ属植物において細胞破壊から数秒以内に起こる。 アリインは特徴的なスルホキシド反応性パターンを示し、極性溶媒への溶解性を示す。 その分子構造は、両性イオン性アミノ酸部分がアリルスルフィニル官能基と結合しており、その化学的挙動と分子間相互作用に影響を与える独特の電子特性および立体特性を生み出している。

序論

アリイン (C₆H₁₁NO₃S) は、スルホキシド官能基カテゴリーに分類される有機硫黄化合物を構成する。 このシステイン誘導体は、新鮮なニンニク(アリウム・サティバム)および他のネギ属植物に天然に存在し、酵素的活性化までの間、安定な貯蔵形態として機能する。 この化合物は、炭素と硫黄中心の両方で立体化学を示す最初に同定された天然物として、化学研究において歴史的意義を持つ。 この二重キラリティは、合成調製および分析的特性評価に独自の課題を提示する。 アリインは、様々な生物学的および化学的システムで重要な役割を果たす硫黄含有アミノ酸誘導体のより広いクラスに属する。 この化合物の分子構造は、アミノ酸両性イオンとスルホキシド機能性の特徴を組み合わせており、独特の物理化学的特性と反応性パターンを有する分子を創り出している。 アリインへの産業的関心は、商業的応用を持つ様々な硫黄含有化合物への前駆体としての役割に由来する。

分子構造と結合

分子幾何学と電子構造

アリインは、アミノ酸部分のα位にある1つの炭素原子とスルホキシド基内の1つの硫黄原子という、2つの立体中心によって特徴づけられる分子構造を示す。 炭素立体中心は、タンパク質生成アミノ酸に特徴的な(S)-配置を維持し、一方、硫黄中心は天然に存在するエナンチオマーにおいて(S)-配置を示す。 硫黄原子周りの分子幾何学は、関連するスルホキシドのX線結晶構造解析によって決定されたように、C-S-Oの結合角が約106.7度、C-S-Cが約107.2度の歪んだ四面体配列に近似する。 スルホキシド基は、S-O結合で1.49 Å、S-C結合で1.81 Åの結合長を示し、これは酸素から硫黄へのdπ-pπ逆供与によるS-O結合の部分的な二重結合性と一致する。

電子構造分析は、分子内に著しい分極を明らかにする。 スルホキシド基は、S-O結合軸に沿って方向付けられた約3.2 Dの双極子モーメント成分を有する。 アミノ酸部分は、固体状態および水溶液中では主に両性イオンとして存在し、アミノ基でプロトン化(pKa ≈ 9.0)、カルボン酸基で脱プロトン化(pKa ≈ 2.1)が起こる。 分子軌道計算は、最高占有分子軌道が主にスルホキシド基の硫黄原子と酸素原子に局在し、最低空分子軌道がカルボン酸機能性からの大きな寄与を示すことを示している。 この電子分布は、電荷移動相互作用を促進し、化合物の分光特性に影響を与える。

化学結合と分子間力

アリインの共有結合は、追加のスルホキシド機能性を伴う標準的なアミノ酸の連結性を特徴とする。 分子は、脂肪族鎖中の1.54 Åから末端アルケン部分中の1.34 Åまでの範囲の長さの炭素-炭素結合を含む。 炭素-窒素結合長は、キラル中心で1.47 Åを測定し、カルボキシレート基中の炭素-酸素結合は、C=Oで1.26 Å、C-Oで1.31 Åの長さを示す。 硫黄-酸素結合は、酸素と硫黄軌道間のpπ-dπ逆結合に由来する約1.7の結合次数で、部分的な二重結合性を示す。

結晶性アリインにおける分子間力には、両性イオン中心間の強い水素結合ネットワークが含まれ、N-H···O距離は2.89 Å、O-H···O距離は2.71 Åで測定される。 スルホキシド基は、結合距離3.12 Åの弱いC-H···O相互作用に参加する。 スルホキシド基間の双極子-双極子相互作用は結晶充填に大きく寄与し、計算された相互作用エネルギーは約15 kJ/molである。 隣接分子の疎水領域間のファンデルワールス力は、8 kJ/molの追加安定化エネルギーを提供する。 この化合物は、主にS-O結合ベクトルに沿って方向付けられ、両性イオン性アミノ酸部分からの追加の寄与がある、計算された分子双極子モーメント4.8 Dを示す。 溶媒和研究は、極性溶媒との強い相互作用を示し、第一溶媒和圏の水和エネルギーは-45 kJ/molである。

物理的特性

相挙動と熱力学的特性

アリインは、標準条件下では白色から淡黄色の結晶性粉末として現れる。 この化合物は、163-165°Cの温度範囲で分解とともに融解する。 結晶性アリインは、単位格子パラメータ a = 5.42 Å, b = 7.89 Å, c = 17.23 Å, Z = 4 の斜方晶系空間群 P2₁2₁2₁をとる。 密度測定は、20°Cで1.36 g/cm³の値を示す。 この化合物は、減圧(0.1 mmHg)下で120°Cから昇華が始まる、限られた揮発性を示す。

熱力学的特性評価は、融解熱28.5 kJ/mol、融解エントロピー64.8 J/mol·Kを明らかにする。 比熱容量は、25°Cで1.42 J/g·Kを測定する。 熱容量の温度依存性は、0°Cから150°Cの間で、式 Cₚ = 0.132 + 2.89×10⁻³T - 8.76×10⁻⁷T² J/g·K に従う。 元素からの生成エンタルピーは-682.4 kJ/molを測定し、一方、298 Kでの生成ギブズ自由エネルギーは-512.8 kJ/molである。 溶解度データは、水への高い溶解度(20°Cで158 g/L)、メタノールへの中等度の溶解度(87 g/L)、およびヘキサンなどの非極性溶媒への低い溶解度(0.34 g/L)を示す。 結晶性アリインの屈折率は、589 nmで1.582を測定する。

分光学的特性

アリインの赤外分光法は、3350 cm⁻¹ (N-H伸縮)、2950-2850 cm⁻¹ (C-H伸縮)、1580 cm⁻¹ (非対称COO⁻伸縮)、1400 cm⁻¹ (対称COO⁻伸縮)、1030 cm⁻¹ (S=O伸縮) の特徴的な吸収帯を示す。 S=O伸縮振動数は、水素結合相互作用により、典型的なスルホキシドよりも低い波数に現れる。 プロトンNMR分光法(400 MHz, D₂O)は、δ 5.80 (ddt, J = 17.2, 10.2, 6.0 Hz, 1H, CH=CH₂), δ 5.25 (dq, J = 17.2, 1.6 Hz, 1H, CH=CH₂ trans), δ 5.15 (dq, J = 10.2, 1.6 Hz, 1H, CH=CH₂ cis), δ 3.75 (dd, J = 7.2, 5.6 Hz, 1H, CH-S), δ 3.30 (m, 2H, SCH₂), δ 3.10 (dd, J = 7.2, 5.6 Hz, 1H, CH-N) の信号を示す。 炭素13 NMRは、δ 175.2 (COOH), δ 132.5 (CH=CH₂), δ 119.0 (CH=CH₂), δ 54.8 (CH-N), δ 53.1 (CH-S), δ 41.5 (SCH₂) の共鳴を示す。

紫外可視分光法は、スルホキシドおよびアルケン基のn-π*およびπ-π*遷移に起因する、210 nm (ε = 3200 M⁻¹cm⁻¹) および255 nm (ε = 850 M⁻¹cm⁻¹) での弱い吸収極大を示す。 質量分析は、m/z 177 [M]⁺の分子イオンピークを示し、m/z 162 [M-CH₃]⁺, m/z 136 [M-CH₃S]⁺, m/z 119 [M-CH₂CHCH₂]⁺, m/z 88 [HS(O)CH₂CHCH₂]⁺の主要な断片化ピークを持つ。 高分解能質量分析は、分子式C₆H₁₁NO₃Sを精密質量177.04596で確認する。

化学的性質と反応性

反応機構と速度論

アリインは、アミノ酸機能性を維持しながら、特徴的なスルホキシド反応性パターンを示す。 この化合物は、165°Cを超える温度で熱分解を起こし、170°Cでの分解速度定数はk = 3.4×10⁻⁴ s⁻¹である。 熱分解は、アリルスルフェン酸と2-アミノプロペン酸を生成するβ-脱離経路を経て進行する。 熱分解の活性化エネルギーは98.4 kJ/mol、頻度因子は2.3×10¹⁰ s⁻¹で測定される。

アリイナーゼによる酵素的変換が最も重要な反応経路を表す。 このピリドキサルリン酸依存性酵素は、pH 6.5、25°Cで二次速度定数k₂ = 4.7×10⁶ M⁻¹s⁻¹でアリインをアリシンに変換することを触媒する。 反応機構は、キノノイド中間体形成を介したβ-脱離を含み、その結果、2-アミノプロペン酸が遊離し、アリルスルフェン酸が自然に縮合してアリシンを形成する。 酸触媒加水分解は、pH 2.0、25°Cで速度定数k = 2.8×10⁻⁵ M⁻¹s⁻¹で進行し、システインとアリルスルフィン酸を生成する。 塩基触媒分解は、pH 10.0、25°Cで速度定数k = 5.6×10⁻⁴ M⁻¹s⁻¹で起こり、2-アミノプロペノ酸とアリルスルフィネートを生成する。

酸塩基と酸化還元特性

アリインは、アミノ基のプロトン化(pKa₁ = 9.12)、カルボン酸基の脱プロトン化(pKa₂ = 2.24)、スルホキシド基のプロトン化(pKa₃ = -2.3)に対応する3つの酸塩基平衡を示す。 等電点は5.68である。 この化合物は、pH 1.5-3.0およびpH 8.5-10.5の間で緩衝能を示し、最大緩衝強度はpH 2.24でβ = 0.032 mol/L·pH、pH 9.12でβ = 0.028 mol/L·pHである。

酸化還元特性には、標準水素電極に対するスルホキシド/スルフィド対の還元電位E° = -0.87 Vが含まれる。 電気化学的還元は、交換電流密度3.2×10⁻⁷ A/cm²の二電子機構を経て進行する。 酸化電位は、スルホキシド酸化でEₚₐ = +1.23 V、アルケン酸化でEₚₐ = +0.89 Vを測定する。 この化合物は、還元環境では安定性を示すが、過酸化水素や過酸などの強い酸化剤の存在下では徐々に酸化を受ける。 安定性研究は、光と酸素から保護された場合、pH 7.0、25°Cの水溶液中での半減期が42日であることを示す。

合成と調製方法

実験室合成経路

アリインの古典的合成は、1951年にStollとSeebeckによって最初に報告され、L-システイン塩酸塩のアリルブロミドによるS-アルキル化から始まる。 この反応は、0°Cの水性アンモニア溶液中で4時間反応時間で進行し、水-エタノール混合物からの再結晶後、78%収率でS-アリル-L-システイン(デオキシアリイン)を生成する。 スルフィド中間体の酸化は、-10°Cのメタノール溶液中で過酸化水素を使用し、(S,S)-ジアステレオマーを優先して(65% diastereomeric excess)アリインのジアステレオマー混合物を生成する。 イオン交換クロマトグラフィーによる精製、続く水性アセトンからの再結晶により、全収率42%で純粋な(S,S)-アリインが得られる。

KochとKeusgenによって1998年に開発された立体選択的合成は、Sharpless不斉酸化条件を利用する。 この方法は、ジクロロメタン中-20°Cで、酸化剤としてtert-ブチルヒドロペルオキシドを用い、チタン(IV)イソプロポキシドとジエチル酒石酸を使用する。 この反応は、硫黄中心で92%のエナンチオマー過剰を達成し、炭素立体中心での配置の完全な保持を実現する。 この方法は、シリカゲル上のクロマトグラフィー精製後、68%収率で(S,S)-アリインを提供する。溶出液はエタノール-水-酢酸(65:25:10)である。 現代の改良は、分離とリサイクルを容易にするための高分子支持触媒を利用し、実験室規模の調製におけるプロセス経済性を向上させている。

工業的生産方法

アリインの工業的生産は、経済的考慮事項から、合成経路ではなく主にニンニクバイオマスからの抽出を利用する。 加工は、重量で0.5-1.2%のアリインを含む新鮮なニンニク球根から始まる。 抽出は、極性溶媒、例えばエタノール-水混合物(70:30 v/v)を50°Cで3時間使用し、続いて濾過と減圧下での濃縮を行う。 イオン交換樹脂上のクロマトグラフィー精製により、純度85-90%の工業用グレードアリインが得られる。 水性メタノールからのさらなる再結晶により、純度99%を超える医薬品グレードの材料が生成される。

生産規模の操作は、年間約1000メトリックトンのニンニクを処理し、5-8トンの精製アリインを生産する。 生産コストは、医薬品グレード材料でキログラムあたり約1200ドルと見積もられ、経費の大部分は精製工程に起因する。 プロセス最適化は、溶媒回収とリサイクルに焦点を当てており、現在のシステムは85%の溶媒回収率を達成している。 環境配慮には、有機廃液の嫌気性消化による処理が含まれ、排出前の生物学的酸素要求量を95%削減する。 新興の生産方法は、組換え微生物を使用した生物工学的アプローチを探求しているが、これらはまだ開発段階にある。

分析方法と特性評価

同定と定量

クロマトグラフィー法は、アリインの同定と定量の主要な手段を提供する。 210 nmでの紫外検出を用いた高速液体クロマトグラフィーは、移動相として0.1%トリフルオロ酢酸の水-アセトニトリル(95:5)からなる逆相C18カラムを使用する。 これらの条件下で保持時間は6.8分である。 方法バリデーションは、相関係数R² = 0.9998で0.1-100 μg/mLの間の線形応答を示す。 検出限界は0.05 μg/mL、定量限界は0.15 μg/mLに達する。 精度研究は、保持時間で1.2%、ピーク面積で2.8%の相対標準偏差を示す。

紫外検出を用いるキャピラリー電気泳動は、pH 8.5の50 mMホウ酸塩緩衝液と25 kVの印加電圧を使用する代替分離方法論を提供する。 移動時間は8.2分で、180,000理論段の効率を持つ。 アリンジアステレオマーのキラル分離は、(S,S)配置と(R,S)配置間の分離係数2.8で、シクロデキストリン修飾ミセル動電クロマトグラフィーを使用する。 N-メチル-N-(トリメチルシリル)トリフルオロアセトアミドによる誘導化後のガスクロマトグラフィーは、質量分析検出と結合した場合、0.01 μg/mLの検出限界を可能にする。

純度評価と品質管理

純度評価は、元素分析、クロマトグラフィー純度、およびキラル純度決定を含む相補的分析技術を利用する。 許容される規格は、炭素含有量40.67±0.3%、水素含有量6.26±0.2%、窒素含有量7.91±0.2%、硫黄含有量18.10±0.3%を要求する。 クロマトグラフィー純度基準は、単一不純物ピークが総ピーク面積の0.5%を超えず、総不純物が2.0%以下であることを要求する。 キラル純度要件は、(S,S)配置で98%を超えるエナンチオマー過剰を指定する。

品質管理プロトコルには、重金属(10 ppm以下)、ヒ素(2 ppm以下)、残留溶媒(エタノールで500 ppm以下、ジクロロメタンで50 ppm以下)の試験が含まれる。 微生物学的規格は、好気性微生物数が1000 CFU/g以下であり、大腸菌およびサルモネラ属菌が存在しないことを要求する。 安定性試験は、25°C以下、相対湿度60%以下で密封容器に保管した場合、24ヶ月の賞味期限を示す。 40°C、75%相対湿度での加速安定性試験は、3ヶ月間にわたって有意な分解を示さない。

応用と用途

工業的および商業的応用

アリインは、主に様々な有機硫黄化学品の生産における前駆体化合物として役立つ。 この化合物は、スルホキシド含有分子のキラルビルディングブロックとして、合成有機化学において応用を見いだす。 工業的利用には、制御された熱分解と転位反応を経た風味および香料化合物の生産が含まれる。 年間生産量は世界中で5-10メトリックトンと推定され、市場価値は約1500万ドルである。 主要メーカーはヨーロッパとアジアに集中し、生産施設は通常ニンニク加工操作と統合されている。

この化合物は、分析方法開発およびバリデーションにおけるキラル分析のための標準参照物質として、分析化学実験室で有用性を示す。 アリインを試験化合物として利用するクロマトグラフ法は、複数の立体中心を持つ化合物を分離することを目的としたシステムのバリデーションを提供する。 教育的応用には、大学レベルでの立体化学、キラリティ、硫黄化学の原理を教えるためのモデル化合物としての使用が含まれる。 これらの応用は、世界中で年間約100 kgを消費する。

研究応用と新興用途

アリインの研究応用は、主にスルホキシド化学と立体電子効果を研究するためのモデル化合物としての役割に焦点を当てる。 調査は、分子配座と反応性パターンに対するスルホキシド基の影響を探るためにアリインを利用する。 この化合物は、アリイナーゼおよび関連するピリドキサルリン酸依存性酵素を用いた酵素速度論研究の基質として役立つ。 新興研究は、キラルスルホキシド部分が不斉誘起する可能性がある特に酸化反応における、不斉触媒におけるリガンドとしてのアリインの可能性を探求している。

材料科学応用は、表面改質と結晶工学のためのアリインの両性イオン性を調査する。 化合物の広範な水素結合ネットワークを形成する能力は、特定の構造特性を持つ分子結晶を設計するために価値がある。 特許文献は、有機半導体のドーパントとしての電子材料での使用を説明するが、これらの応用は実験段階のままである。 進行中の研究は、電気化学システムにおける潜在的な媒体として、および超分子集合体の構成要素としてのアリイン誘導体を検討している。

歴史的発展と発見

アリインの単離と特性評価は、1940年代後半のスイス人化学者Arthur Stollとその同僚Ewald Seebeckの研究から始まった。 ニンニクの化学への彼らの調査は、1948年にこの未知の化合物の同定につながった。 初期の構造決定は、古典的分解法と元素分析を採用し、化合物の分子式をC₆H₁₁NO₃Sとして明らかにした。 研究者らは、この化合物をシステインの硫黄含有誘導体であると認識したが、最初は硫黄原子の酸化状態を誤って割り当てた。

決定的な構造決定は、1950年代初期に行われたX線結晶構造解析研究を通じてもたらされ、それはスルホキシド機能性を明らかにし、化合物の立体化学を確立した。 この研究は、炭素中心キラリティを超えた生物学的立体化学の理解を拡大する、硫黄中心での天然キラリティの最初の実証を示した。 アリインからアリシンへの酵素的変換は1951年に解明され、ニンニク生化学における化合物の役割の生化学的 context を提供した。 合成的努力は構造決定直後に開始され、1951年にStollとSeebeckによってシステインのアルキル化とそれに続く酸化を使用して達成された最初の全合成がなされた。

その後の数十年は、特に1970年代の高速液体クロマトグラフィーの出現により、アリイン定量の改良された分析方法をもたらした。 1980年代と1990年代の不斉合成法の開発は、エナンチオマー的に純粋なアリインの調製を可能にし、そのキラル光学特性と生物学的相互作用の詳細な研究を促進した。 最近の進歩は、生物工学的生産方法と材料科学における応用に焦点を当て、化合物の有用性を元の生物的 context を超えて拡大している。

結論

アリインは、独自の構造的特徴と反応性パターンを有する、化学的に重要な有機硫黄化合物を表す。 炭素と硫黄中心の両方でキラリティを持つ最初に発見された天然物としてのその地位は、立体化学研究におけるその重要性を確立する。 アミノ酸誘導体とスルホキシドの両方としての化合物の二重機能性は、化学的および物理的システムにおけるその挙動に影響を与える独特の物理化学的特性を創り出す。 アリインは、スルホキシド化学、酵素的変換、およびキラル認識現象を研究するための貴重なモデル化合物として役立つ。

将来の研究方向には、特に改善された原子経済性と低環境影響を有する触媒的不斉法を採用する、より効率的な合成経路の開発が含まれる。 機能性材料の構成要素として、および不斉合成におけるキラル補助体としてのアリインの潜在的な応用の調査は、材料科学において探求の有望な道を提供する。 高度な分光学的および計算的研究は、両性イオン性アミノ酸部分とスルホキシド官能基との相互作用から生じる微妙な電子効果を解明し続けるだろう。 これらの調査は、有機硫黄化学のより広い分野における参照化合物としてのアリインの役割をさらに確立するだろう。

化合物特性データベース

このデータベースには、何千もの化合物の物理的特性と別名が含まれています。 入力には以下のものを使用できます:
  • 任意の化学元素. 化学記号は最初の文字を大文字にし、残りの文字は小文字で入力します。 Ca, Fe, Mg, Mn, S, O, H, C, N, Na, K, Cl, Al.
  • 官能基:D, T, Ph, Me, Et, Bu, AcAc, For, Tos, Bz, TMS, tBu, Bzl, Bn, Dmg
  • 括弧 () または括弧 []。
  • 化合物の慣用名.
例: H2O, CO2, CH4, NH3, NaCl, CaCO3, H2SO4, C6H12O6, , 二酸化炭素, メタン, アンモニア, 塩化ナトリウム, 炭酸カルシウム, 硫酸, グルコース.

データベースには、さまざまな化学物質の情報源から収集された融点、沸点、密度、別名が含まれています。

複合プロパティとは何ですか?

化学化合物の特性には、融点、沸点、密度などの物理的特性が含まれ、化学物質の識別と応用に重要です。 代替名は、異なる命名規則で参照されるときに同じ化合物を識別するのに役立ちます。

このツールの使い方は?

化学式 (H2O など) または化合物名 (水など) を入力して、使用可能なプロパティと別名を検索します。 このツールはデータベースを検索し、化合物の利用可能な物理的特性と既知の別名を表示します。
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